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轉(zhuǎn)染是個(gè)坎,遠(yuǎn)慕生物教你怎么翻過去

2019-10-17 14:14 作者:洛辰 來源:上海遠(yuǎn)慕生物試劑

     從基因表達(dá)到RNA干擾,再到如今大熱的基因組編輯,它們都離不開一個(gè)前提:DNA或RNA分子能夠高效地導(dǎo)入細(xì)胞內(nèi)并發(fā)揮功能。然而,問題是,細(xì)胞并不想接收它們,而細(xì)胞膜也是一個(gè)可怕的屏障,它帶的是負(fù)電荷,核酸同樣帶負(fù)電荷。

     不過,人類的智慧是無限的。人們已經(jīng)設(shè)計(jì)出各種方法來繞過這一屏障,包括化學(xué)方法,利用帶正電的轉(zhuǎn)染試劑來中和帶負(fù)電的核酸;生物學(xué)方法,采用經(jīng)過遺傳學(xué)改造的病毒將非病毒基因轉(zhuǎn)移至細(xì)胞內(nèi);以及物理方法,在細(xì)胞膜上開孔,將核酸直接送入細(xì)胞。

     當(dāng)然,各種細(xì)胞適用的轉(zhuǎn)染條件都可能不同,正所謂甲之蜜糖、乙之pi霜,并沒有一種放之四海而皆準(zhǔn)的方法。因此,研究人員需要根據(jù)你的細(xì)胞類型和實(shí)驗(yàn)要求來選擇理想的方法。何謂理想的方法?那就是轉(zhuǎn)染效率高、細(xì)胞毒性低、對(duì)正常生理的影響zui小,并且簡單可重復(fù)。這看似挺難,好在Thermo Fisher(原Life Technologies)帶來了一個(gè)轉(zhuǎn)染的整體解決方案,可幫助你快速實(shí)現(xiàn)目標(biāo)。

既高效又溫和的DNA轉(zhuǎn)染——Lipofectamine? 3000

 

      對(duì)于DNA的轉(zhuǎn)染,大家往往在第一時(shí)間想到Lipofectamine? 2000。這種金招牌的陽離子脂質(zhì)體試劑幾乎是人們的首xuan,目前引用文獻(xiàn)已經(jīng)超過50,000篇。通過帶負(fù)電荷的核酸與帶正電荷的合成脂質(zhì)體試劑之間的靜電作用,核酸-陽離子脂質(zhì)體試劑復(fù)合物自發(fā)形成。細(xì)胞通過內(nèi)吞作用攝取復(fù)合物,然后釋放至胞漿。一旦進(jìn)入細(xì)胞,轉(zhuǎn)染DNA轉(zhuǎn)移至細(xì)胞核內(nèi),通過未知的機(jī)制表達(dá)。

      之所以如此受歡迎,首先是因?yàn)樗軌蚋咝мD(zhuǎn)染各種細(xì)胞系,幫助在各種實(shí)驗(yàn)的第一步獲得漂亮的結(jié)果,其次也因?yàn)樗鼘?duì)DNA和RNA皆有效,適合DNA和RNA的共轉(zhuǎn)染。不過,轉(zhuǎn)染效率和細(xì)胞毒性,正如硬幣的正反兩面。Lipofectamine 2000在獲得贊揚(yáng)聲的同時(shí),也收到毒性高的詬病。對(duì)于頑強(qiáng)的細(xì)胞系而言,這可能不是問題,但是嬌弱的原代細(xì)胞和干細(xì)胞卻折騰不起。

     為此,Thermo Fisher的科學(xué)家優(yōu)化了轉(zhuǎn)染過程的四個(gè)步驟,并結(jié)合zui先進(jìn)的脂質(zhì)體納米微粒技術(shù),開發(fā)出zui新的Lipofectamine 3000試劑。它提供了出眾的轉(zhuǎn)染性能和可重復(fù)的結(jié)果,適用于各種難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞和常見的細(xì)胞。由于轉(zhuǎn)染性能出眾,你在轉(zhuǎn)染過程中可減少試劑的用量,從而進(jìn)一步降低潛在的毒性風(fēng)險(xiǎn)。

     3000與2000相比,轉(zhuǎn)染效率如何?研究人員當(dāng)然也進(jìn)行了比較。他們使用這兩種試劑轉(zhuǎn)染來自各種組織的癌細(xì)胞。研究證實(shí),Lipofectamine 3000試劑的轉(zhuǎn)染性能明顯高于2000。使用Lipofectamine 2000時(shí),只有25%的癌癥細(xì)胞系被認(rèn)為是容易轉(zhuǎn)染的(轉(zhuǎn)染效率高于50%),而使用Lipofectamine 3000,這個(gè)比例高達(dá)60%。里斯本大學(xué)的Rui Eduardo Castro博士在使用過Lipofectamine 3000后興奮地說道:“我們非常高興且驚訝地看到, 在難以轉(zhuǎn)染的細(xì)胞系中使用Lipofectamine 3000,可將轉(zhuǎn)染效率提高10倍,而且減少了細(xì)胞死亡率。結(jié)果真是太棒了!”

      因此,即使是難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞,使用Lipofectamine 3000也很容易獲得滿意的結(jié)果。還是有點(diǎn)不滿意?沒關(guān)系,Thermo Fisher建議你嘗試一下不同的DNA濃度和細(xì)胞密度。采用陽離子脂質(zhì)體介導(dǎo)的轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染時(shí)貼壁細(xì)胞達(dá)到70-90%匯合,懸浮細(xì)胞達(dá)5 x 105至2 x 106個(gè)細(xì)胞/mL,可以獲得zui佳的結(jié)果。還是不行?那就試試mRNA轉(zhuǎn)染吧。

      mRNA也能高效轉(zhuǎn)染?當(dāng)然!——Lipofectamine? MessengerMAX?

     關(guān)于mRNA轉(zhuǎn)染,人們往往有多種誤解。有人認(rèn)為,mRNA難以制備。其實(shí),這方面的工具有很多,比如Thermo Fisher的mMESSAGE mMACHINE T7 Ultra轉(zhuǎn)錄試劑盒,就能制備20-40 ?μg即用型mRNA。還有人認(rèn)為,mRNA不穩(wěn)定,容易降解。No,no!只要采取一些簡單的預(yù)防措施,就能確保mRNA穩(wěn)定:使用不含RNA酶的試劑和吸頭,分裝mRNA并置于-80?C保存。

    與DNA轉(zhuǎn)染相比,mRNA轉(zhuǎn)染只需進(jìn)入細(xì)胞質(zhì),而非細(xì)胞核,從而大大提高了有絲分裂后細(xì)胞或緩慢分裂細(xì)胞的轉(zhuǎn)染效率。這樣,利用Lipofectamine MessengerMAX轉(zhuǎn)染mRNA可以實(shí)現(xiàn)更快速的蛋白質(zhì)表達(dá),在轉(zhuǎn)染細(xì)胞中達(dá)到更高的表達(dá)一致性,特別適合原代神經(jīng)元、神經(jīng)干細(xì)胞和永生化神經(jīng)細(xì)胞。

    在基因組編輯的應(yīng)用中,Lipofectamine MessengerMAX試劑通過高效轉(zhuǎn)染提高了GeneArt? CRISPR核酸酶mRNA的剪切和重組效率,可以大大提高基因修飾的效率并簡化下游過程。此外,mRNA不會(huì)入核,這下老板再也不用擔(dān)心基因組整合的風(fēng)險(xiǎn)了。

    也許你會(huì)擔(dān)心,操作起來一定很復(fù)雜吧。其實(shí),只要制備好了mRNA,轉(zhuǎn)染的基本步驟與DNA相同,不外乎是稀釋、孵育這些,難不倒諸位高手。況且還可以購買陽性對(duì)照GFP mRNA同時(shí)轉(zhuǎn)一下,效果好不好,一看就知道。

CRISPR好幫手——Lipofectamine? CRISPRMAX? Cas9轉(zhuǎn)染試劑

     對(duì)于基因組編輯,有些人使用CRISPR質(zhì)粒,有些人使用Cas9 mRNA。其實(shí),使用Cas9蛋白可在原代細(xì)胞和干細(xì)胞中獲得出色的切割效率。它避免了轉(zhuǎn)錄或翻譯,可立即發(fā)揮作用,快速去除,zuida程度地降低了脫靶剪切的幾率。GeneArt? Platinum? Cas9核酸酶就是這樣一種野生型的Cas9蛋白。

     也許你要問,如何將Cas9蛋白導(dǎo)入細(xì)胞呢?那就要依靠Lipofectamine? CRISPRMAX? Cas9轉(zhuǎn)染試劑了。這是第一款為CRISPR-Cas9蛋白轉(zhuǎn)染而優(yōu)化的脂質(zhì)體納米微粒轉(zhuǎn)染試劑。這款試劑簡單易用,高效低毒,如今已在iPSC、mESC、CHO等20多種細(xì)胞上進(jìn)行了檢驗(yàn)。與電穿孔相比,它更為溫和,因此所需的細(xì)胞較少,每個(gè)反應(yīng)的成本較低。此外,它也能輕松擴(kuò)展到高通量實(shí)驗(yàn),是CRISPR實(shí)驗(yàn)的好幫手。

RNAi的不二之選——Lipofectamine? RNAiMAX

    RNAi作為基因功能研究的基本工具,如今已應(yīng)用在蛋白質(zhì)抑制研究、表型分析、通路分析和藥物靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)上。小分子RNA(siRNA、miRNA)有其自身的特點(diǎn),也就需要不一般的轉(zhuǎn)染試劑。

    Lipofectamine? RNAiMAX 轉(zhuǎn)染試劑就是專門為小分子RNA而優(yōu)化的,可以高效地將小分子RNA導(dǎo)入廣泛的細(xì)胞系,包括常見的細(xì)胞類型、干細(xì)胞、原代細(xì)胞以及難轉(zhuǎn)染的細(xì)胞。

    這種轉(zhuǎn)染試劑可以在10倍試劑濃度范圍內(nèi)獲得zuida的干擾效果以及極佳的細(xì)胞存活率,這個(gè)特點(diǎn)使得Lipofectamine? RNAiMAX的轉(zhuǎn)染條件極易優(yōu)化,以便在實(shí)驗(yàn)中使用zui低的siRNA濃度,從而降低細(xì)胞毒性。盡管Lipofectamine? RNAiMAX的說明書建議以10 nM siRNA 作為優(yōu)化干擾效果的起始濃度,但是僅用1 nM siRNA 也可以獲得較好的干擾效果。

    Lipofectamine? RNAiMAX的操作也相當(dāng)簡單,轉(zhuǎn)染后無需去除轉(zhuǎn)染復(fù)合物,無需更改或添加培養(yǎng)基。如果轉(zhuǎn)染的效果不理想,可以試試反向轉(zhuǎn)染,或改變siRNA用量,或轉(zhuǎn)染時(shí)的細(xì)胞密度。另外,這款試劑只能用于小分子RNA的轉(zhuǎn)染,不能用于共轉(zhuǎn)染。如果需要共轉(zhuǎn)染,只能借助Lipofectamine 3000或2000。

體內(nèi)轉(zhuǎn)染不再是難題——Invivofectamine 3.0

    眾所周知,原代細(xì)胞的轉(zhuǎn)染比傳代細(xì)胞要難得多,而體內(nèi)轉(zhuǎn)染又比體外轉(zhuǎn)染要難。對(duì)于這種高難度的實(shí)驗(yàn),勉強(qiáng)使用傳統(tǒng)的體外轉(zhuǎn)染試劑(如脂質(zhì)體)是沒有幸福的,zui好還是用專門的體內(nèi)轉(zhuǎn)染試劑,比如Thermo Fisher的Invivofectamine系列。一眨眼,Invivofectamine試劑已經(jīng)升級(jí)到第三代。

    Invivofectamine 3.0試劑是一種無動(dòng)物來源成分的脂質(zhì)納米顆粒,通過尾部靜脈注射,能夠?qū)iRNA和miRNA高效導(dǎo)入小鼠肝臟細(xì)胞。轉(zhuǎn)染效果如何?專家們做過實(shí)驗(yàn),將Invivofectamine 3.0試劑與針對(duì)Factor VII或PPIB的siRNA混合,以每千克小鼠體重1 mg的注射量進(jìn)行靜脈注射,zui終實(shí)現(xiàn)了高達(dá)85%的knockdown。與之前的產(chǎn)品相比,新試劑只需更少的siRNA,即可實(shí)現(xiàn)有效knockdown。此外,單次注射Invivofectamine 3.0試劑/siRNA復(fù)合物后,knockdown效果可維持長達(dá)3周。想要靶向其它器官?古朵的科學(xué)家還進(jìn)行了胰腺和脾臟的實(shí)驗(yàn),取得了很好的效果。

    至于它的體內(nèi)毒性,專家們也曾評(píng)估過。他們?cè)谠噭┳⑸浜蟮亩鄠€(gè)時(shí)間點(diǎn)進(jìn)行血液化學(xué)分析及細(xì)胞因子檢測(cè)。結(jié)果表明轉(zhuǎn)染后每個(gè)個(gè)體的生物標(biāo)志物的水平與未注射該試劑的個(gè)體相比并沒有顯著差異。這表明復(fù)合物表現(xiàn)出極低的體內(nèi)毒性。這種試劑也相當(dāng)穩(wěn)定,即使反復(fù)凍融4次,也不會(huì)造成性能損失。

終ji武器——Neon轉(zhuǎn)染系統(tǒng)

    如果這些熱門工具都不管用,那我們只能祭出終ji武器——Neon轉(zhuǎn)染系統(tǒng)。這是Thermo Fisher第二代的臺(tái)式電穿孔設(shè)備,可將核酸(包括質(zhì)粒DNA和siRNA)高效導(dǎo)入幾乎任意一種動(dòng)物細(xì)胞內(nèi),包括難以轉(zhuǎn)染的原代細(xì)胞、干細(xì)胞和造血系統(tǒng)來源的細(xì)胞,同時(shí)保持高的細(xì)胞活性。

    與傳統(tǒng)的電穿孔儀不同,Neon系統(tǒng)并沒有傳說中的電轉(zhuǎn)杯,而是用一個(gè)特殊的移液器吸頭取代。移液器吸頭內(nèi)使用24K鍍金電極,可形成更為均勻的電場,同時(shí)zuida限度地減少溫度升高和pH值變化幅度,在確保細(xì)胞高效轉(zhuǎn)染的同時(shí),也更加溫和,保證細(xì)胞存活率更高。

    Neon系統(tǒng)帶有兩種吸頭:10 μl和100 μl,讓你可根據(jù)實(shí)驗(yàn)要求靈活選擇,而不像傳統(tǒng)電穿孔儀那樣只能轉(zhuǎn)染固定量的細(xì)胞。使用Neon系統(tǒng),每次zui少可轉(zhuǎn)染2×104個(gè)細(xì)胞,zui多可轉(zhuǎn)染6×106個(gè)細(xì)胞。當(dāng)然,這并非絕對(duì)。若你的細(xì)胞更少或更多,也可一試,據(jù)專家介紹,有一位用戶曾成功轉(zhuǎn)染了5000個(gè)原代mao囊細(xì)胞。

    Neon也是一個(gè)開放的系統(tǒng),讓用戶能夠單獨(dú)控制每個(gè)參數(shù)。廠家也提供了一個(gè)數(shù)據(jù)庫,收集各種細(xì)胞類型的建議設(shè)置,你可在這個(gè)基礎(chǔ)上優(yōu)化和調(diào)整。Neon能夠?qū)Χ喾N難以轉(zhuǎn)染的細(xì)胞進(jìn)行高效轉(zhuǎn)染,包括原代星形膠質(zhì)細(xì)胞、原代樹突狀細(xì)胞、Jurkat、小鼠胚胎干細(xì)胞等。多種細(xì)胞類型可獲得超過75%的轉(zhuǎn)染效率。

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