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識破各種污染,遠慕生物拯救您的細胞

2020-03-19 13:18 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑

小伙伴們遇到過這種情況嗎?

當您的課題進行到白熱化程度時

卻發現細胞被污染了

此時大家的心情可謂五味雜陳

形容一下就是

問君能有幾多愁,眼淚恰似一江春水向東流

不過,別擔心

遠慕生物煉就火眼金睛

幫助大家識破各種污染,拯救您的細胞

 

 

我們先來看看污染的真面目,總結下來無非以下幾種類型:

我們一起來分析它們的特征:

 

 

1

真菌-深藏不露

 

真菌之所以深藏不露,是因為它們一般不會導致培養基變渾濁,所以在污染早期,很難發現它們的蹤跡。直到長到一定規模后在鏡下可觀察到分叉細絲狀的菌絲(有些呈管狀,樹枝狀,串珠狀的菌絲)(如圖1,圖2)。這類污染中,為首的污染代表是酵母菌:顯微鏡下常見成串的珠狀物,形態呈卵形,大約比細胞小5~10倍,當其進行出芽生殖時,會聚集成連體結構;爆發污染嚴重時,會造成培養基pH值改變,不易除去。

 

 

圖1. 真菌污染                                                    圖2. 真菌污染

 

 

2

細菌-屢見不鮮

 

細菌種類繁多,分布廣泛,是最容易污染細胞的微生物。

 

 

細菌在顯微鏡下呈黑色細沙狀(如圖3),典型特征是,可以使培養基在短時間內變成黃色或白色渾濁。細胞形態會出現多角,多核狀況;貼壁細胞不附著,停止生長甚至死亡。

 

圖3. 細菌污染

 

 

 

3

支原體-無孔不入

支原體之所以無孔不入是因為它們種類繁多,常以寄生或腐生營養方式生長,廣泛存在于環境之中。支原體是細胞培養過程中的常見污染,經常來源于實驗人員(支原體常見于人體皮膚、呼吸道、生殖道和消化道)、動物源血清及胰酶、消毒不完全的器具。其大小只有0.15~0.3μm,所以能通過一般標準的細胞培養過濾方法,0.22μm過濾膜。其污染特征不是很明顯,增長速度相較于細菌比較緩慢,污染初期(輕微)培養基可能依然清澈不會變黃,所以輕微污染時不容易用常規方法(細胞外觀觀察或是DNA染色法)確認。支原體會緩慢改變細胞形態、增殖、基因表達、蛋白合成及代謝反應,它攜帶的DNA/RNA與蛋白更可能造成QPCR、Western Blot或外泌體實驗結果偏差。

 

 

如下圖所示:

 

圖4. 支原體污染

 

 

 

 

4

黑膠蟲-神秘莫測

黑膠蟲污染后,在鏡下可看到密密麻麻的小黑點在培養基中自主游動。目前科學界對黑膠蟲的身份并無定論。Dr.Cell 目前檢測的黑膠蟲樣本,62%為細菌,38%為支原體。黑膠蟲在鏡下的典型特征呈卵圓狀、球狀、桿狀等,具有細胞毒性,可引起細胞生長遲緩或裂解凋亡。

 

 

 

5

病毒-專一任性

病毒之所以“專一任性”是因為其污染和傳播具有細胞專一性,“鐘情”到一輩子吊死在一顆“樹”上。病毒污染可能來自宿主動物細胞或病人,在細胞培養污染物中是相對最難檢測的。被病毒污染的細胞在顯微鏡下能明顯觀察到細胞碎片增多、腫大、圓縮、脫落等病態變形,嚴重時會在單層細胞上觀察到局部破損空斑(如圖5,圖6)。

圖5. 感染之前 圖6. 感染24小時后

 

 

 

 

6

細胞交叉污染-玉石難分

細胞交叉污染之所以“玉石難分”是因為其長相和實驗所養的目的細胞形態相似,難以分辨。對于細胞株的交叉污染,曾有文獻報道統計,目前使用的細胞株大約有15~20%不是科學家們所認為的細胞,而在生物醫藥領域中,細胞來源和細胞株身份鑒定檢測的觀念是普遍缺乏的。

細胞株的交叉污染,常因不經意的實驗疏忽(不同細胞株分盤時,共享一瓶培養基;槍頭、移液管忘記更換,而造成不同細胞株之間的混合污染;實驗操作人員錄入錯誤細胞株名稱;傳代時的培養皿;冷凍細胞時的凍存管)而發生,繼而造成后續數據搜集錯誤。

目前大部分的科學期刊都已有“細胞相關實驗論文發表前,均需附上細胞鑒定報告”的規定(可查閱:文章發表前要求提供細胞鑒定的雜志),以此保證數據來源的正確性。

那么如何鑒別呢?細胞身份驗證方式:短串聯重復序列(STR)、同功酶分析、染色體組分型、擴增片段長度多態性(AFLP)的特征分析等方法。其中STR,是目前國際細胞庫(包括:ATCC、DSMZ或是JCRB)常用于細胞株身份鑒定方法。

 

 

溫馨提示,至少每半年一次進行細胞鑒定,理想情況每2-3個月鑒定一次,且課題開展前最好先確認使用的細胞身份。

 
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