Z型核酸(Z-DNA)是具有不尋常的左手雙螺旋結構的雙鏈DNA和RNA分子,與經典的右手Watson-Crick雙螺旋相反。這種核酸是40多年前發現的,但迄今為止,我們對其生物學功能的了解仍然很少。
德國科隆大學CECAD衰老研究所的Manolis Pasparakis教授,與德州大學健康科學中心等處的科學家合作,研究了Z-DNA結合蛋白1( ZBP1),這是哺乳動物中已知與Z核酸相互作用的僅有的兩種蛋白質之一。以前顯示ZBP1可以感測某些病毒的遺傳物質,并誘導感染細胞死亡以防止病毒傳播。
但是奇怪的是,在他們較早的研究中,研究人員獲得的證據表明,在沒有病毒感染的情況下,ZBP1還可引起細胞死亡和炎癥。他們發現,當RIPK1(一種抑制ZBP1的蛋白)的功能受損時,ZBP1被激活并引發炎癥性細胞死亡,這被稱為細胞壞死(necroptosis)。
最新研究背后的一個關鍵問題是在沒有病毒感染的情況下如何激活ZBP1。研究人員利用實驗小鼠模型,發現ZBP1的促炎活性取決于其與Z核酸結合的能力,這表明ZBP1被細胞內存在的Z型核酸激活。下一個問題是ZBP1結合哪種類型的內源核酸。Pasparakis說:“我們可以證明ZBP1與雙鏈RNA結合。” “盡管我們目前缺乏實驗方法來證明其具有Z構象,但基于所有可用的結構研究,我們對結果的解釋是ZBP1通過其Za結構域與內源Z-RNA結合。”
雙鏈RNA(dsRNA)在細胞中并不常見,但會在某些病毒基因組的復制過程中形成,并被認為在病毒感染期間提供了激活ZBP1的配體。科學家們推測,細胞dsRNA可以通過內源性逆轉錄因子產生,內源性逆轉錄因子是來自古代逆轉錄病毒感染或活性逆轉錄轉座子,以及“跳躍基因”,后者構成了人類和小鼠一半以上的基因組。
為了了解內源性逆轉錄元件作為dsRNA來源的可能作用,Manolis Pasparakis團隊與Francis Crick研究所的George Kassiotis逆轉錄病毒免疫學實驗室合作。他們發現實際上,對來自小鼠皮膚的RNA測序數據的計算分析表明,大多數互補的,推測為雙鏈的RNA均來自特定組的內源性逆轉錄元件。
這些發現表明,感知細胞dsRNA(大部分源自內源性逆轉錄元件)激活ZBP1,誘導細胞死亡和炎癥,這一機制可能與人體炎癥性病理的發病機制有關,尤其是在具有抑制ZBP1的蛋白質(例如RIPK1)突變的患者中。
作者指出,“ Z-DNA多年來一直保持著神秘感。目前,我們研究其功能的唯一方法是研究能感知其功能的蛋白質。我們取得了一些進展,但是未來還有許多挑戰,比如了解它們為什么,在何處以及如何在一個細胞內形成以及其目的是什么。”
一個特別令人著迷的方面是與內源性逆向元件的聯系。 “目前對這些基因組附件如何影響我們的健康,知之甚少。似乎在進化過程中,一些可以模仿病毒感染的逆轉座子被招募為有用的伙伴元件,應對細胞對損傷,壓力或真正感染的反應,但這種伙伴關系也可能出錯,導致疾病。”
就像在病毒感染期間一樣,ZBP1感知內源性逆轉錄因子產生的Z-RNA,這可能會為細胞死亡和炎癥提供有效的誘因,導致疾病。不過這些研究還處于初期階段,我們還有很長的路要走,未來了解其機制將有助于研發人類疾病新療法。