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遠慕生物提供基因合成定制服務!

2020-05-21 12:02 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑
    客戶提供

    基因序列或蛋白質氨基酸序列

    最終交付

    約4 μg含有目的片段的高純度凍干質粒DNA;

    含有重組質粒的穿刺菌一管(TOP10);

    發貨文件主要包括如下內容:測序結果、COA報告、sqd文件。

    備注:默認合成克隆基因至pUC57載體

    鄭重承諾:對客戶提供的核酸/氨基酸序列或基因合成的結果沒有所有權,并承諾對結果嚴格保密,且不會以任何形式散布到第三方。

    載體選擇主要考慮下述3點:

    1、構建DNA重組體的目的,克隆擴增/表達表達,選擇合適的克隆載體/表達載體。

    2、載體的類型:

    (1)克隆載體的克隆能力—據克隆片段大小(大選大,小選小)。尤其對于病毒載體來說,載體包裝容量的大小是評估能否成功包裝病毒的首要因素。

    ①腺病毒可以插入長約8kb的外源基因。目前,我們包裝過長度為7.5kb外源基因的腺病毒。

    ②慢病毒的包裝容量約為6kb(包含載體帶有的其他抗性基因或報告基因),但是2kb以上的外源基因包裝慢病毒難度就增加了,增大1kb會下降1個單位數量級的滴度,故2kb以上的基因包裝慢病毒需要進行評估。此外,毒性蛋白、凋亡蛋白和膜蛋白(作為受體、轉運蛋白行使功能)等由于其本身的功能,包裝可能會有一定難度。

    ③AAV的總包裝容量是4.7 kb(包含載體中兩個ITR約0.3kb +具體啟動子 + 內含子約0.6kb + 具體熒光標簽 + polyA約0.2kb),所以插入目的基因一般約2kb 左右。由于AAV包裝容量有限,目的基因大于2kb,可考慮去除內含子,因為內含子只是有助于插入的目的基因穩定表達。

    (2)確定表達蛋白的目的,然后再來選擇優勢的表達質粒。一般分為原核表達和真核表達質粒,前者主要用于體外純化蛋白,如帶His-tag的PET系列,帶GST-Tag的PGEX系列,選用不同的表達載體,就得建立相應的純化系統,包括緩沖液的配置、珠子/柱子的選擇等等,還得考慮目的蛋白的可溶性,一般大tag的融合蛋白可溶性要好一些,如GST的。這種原核純化的蛋白一般用來制備單一的、需要量大的蛋白。真核表達載體一般是細胞、體內表達等需要時所用,只需要將它放到細胞或體內細胞即可,唯一考慮的是它的啟動子的選擇,常用都是cmv啟動子的,表達效率較高,也有多種啟動子經過改造的表達載體,一般用來表達需要調控表達時間及表達量的蛋白。

    3、載體MCS中的酶切位點數與組成方向因載體不同而異,適應目的基因與載體易于連接,不產生閱讀框架錯位。

    ①選分子量小的質粒,即小載體(1-1.5kb)→不易損壞,在細菌里面拷貝數也多(也有大載體);

    ②一般使用松弛型質粒在細菌里擴增不受約束,一般10個以上的拷貝,而嚴謹型質粒<10個;

    ③必需具備一個以上的酶切位點,有選擇的余地;

    ④必需有易檢測的標記,多是抗生素的抗性基因。
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