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微生物組影響組織再生和修復(fù)

2020-07-16 11:07 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑

美國Stowers醫(yī)學(xué)研究所的研究人員發(fā)現(xiàn),微生物組的構(gòu)成,與宿主的免疫反應(yīng)、機體的自愈能力之間,有一種明確的聯(lián)系。

他們發(fā)現(xiàn),渦蟲微生物群落的一個急劇變化,可使得這種淡水扁蟲失去它的再生能力。這種相同的變化在人類炎癥性疾病中也曾被觀察到,但是,之前科學(xué)家曾經(jīng)嘗試在較低等生物(如果蠅和斑馬魚)中模仿它,卻被證明是失敗的。

該研究結(jié)果發(fā)表在《eLife》雜志上,提供了一個有價值的模型,用于揭示控制免疫力和再生之間相互作用的基本分子機制,并可能指出新的治療方法,來對抗嚴(yán)重的人類疾病,如慢性不愈合的傷口。

本研究資深作者、Stowers醫(yī)學(xué)研究所和霍華德休斯醫(yī)學(xué)研究所的Alejandro Sánchez Alvarado博士說:“這是第一個動物模型,將內(nèi)生細菌的病理變化與再生抑制聯(lián)系起來。我們知道,一些種類的細菌對我們的健康是至關(guān)重要的,其他種類的細菌則可能使我們很難從疾病中恢復(fù)過來。現(xiàn)在,我們可以研究微生物組不斷變化的性質(zhì)——和免疫系統(tǒng)響應(yīng)這些變化的方式,是如何影響再生過程的自然執(zhí)行的。”

長期以來,研究人員認為,免疫反應(yīng)主要構(gòu)成了有效組織再生和修復(fù)的一道屏障。然而,最近在各種不同生物中的研究表明,它可能對于促進這一過程也發(fā)揮著核心的作用。不過,是什么分子機制驅(qū)動了這些截然相反的結(jié)局,仍不清楚。

Sánchez Alvarado實驗室一次突如其來的困境,提供了一個機會來剖析免疫系統(tǒng)的復(fù)雜雙重性。實驗室渦蟲種群的一部分遭受了一次感染。受感染的動物在眼睛周圍出現(xiàn)病變,這些病變越來越大,直到它們的整個頭部退化。通常情況下,渦蟲僅僅可以再生出一個新的頭,但是感染卻以某種方式挫敗了它們的再生能力。


Sánchez Alvarado的研究團隊和Stowers研究所開發(fā)了一種改進的水槽系統(tǒng),能夠循環(huán)和消毒培養(yǎng)基,從而使他們能夠培養(yǎng)健康的渦蟲,但是他們發(fā)現(xiàn),當(dāng)他們把蠕蟲從該系統(tǒng)中取出來時,它們很快就又生病了。雖然大多數(shù)的實驗室成員對這一發(fā)展感到挫折,這時,新的博士后研究助理Chris Arnold博士,采取了不同的角度。

Arnold說:“我認為這是個完美的誘導(dǎo)模型系統(tǒng)。我們可以選取健康的渦蟲,當(dāng)需要的時候從該系統(tǒng)中去除它們,并將它們放置在使其生病的其他條件下。令人驚訝的是,我們發(fā)現(xiàn),當(dāng)我們從該系統(tǒng)中取出渦蟲時,它們出現(xiàn)了問題,我們可以成功地用抗生素治療它們的組織退化。這表明,可能有細菌參與進來。”

Arnold想要確定有什么樣的細菌生活在渦蟲體內(nèi)。他進行了一次細菌普查,發(fā)現(xiàn)渦蟲的微生物組與人類有著驚人的相似性。當(dāng)渦蟲都是健康的時候,它們體內(nèi)有大量的擬桿菌——一組有益的、支持性共生菌,和少量的變形菌——一組細菌包含一些危險的人類病原體。但是,當(dāng)渦蟲發(fā)展出病變時,他們經(jīng)歷了變形菌的大幅飆升,一些成員已被證明可引起人類消化性潰瘍和胃癌。

研究人員懷疑這并不是細菌本身,而是免疫系統(tǒng)對“影響渦蟲再生能力的細菌”所產(chǎn)生的反應(yīng)。為了驗證這一假設(shè),Arnold使用了一種叫做RNA干擾的先進分子技術(shù),來沉默免疫系統(tǒng)的核心部件。然后,他想探究每一個組件對“渦蟲在感染過程中修復(fù)病變并再生頭部的能力”有何影響。

研究人員發(fā)現(xiàn),當(dāng)他們阻斷一個被稱為TAK1激酶的基因時,渦蟲能夠從感染所致的損傷中得以恢復(fù)。他們著眼于與TAK1激酶相互作用的其他基因,包括TAK1通路的激活劑和抑制劑,并發(fā)現(xiàn)它們中的大多數(shù)也影響再生,但是只有在渦蟲被感染的時候。

Sánchez Alvarado說:“我們的研究結(jié)果表明,在感染過程中有一些關(guān)于再生的特殊情況,不同于正常的再生。有一些基因在一種情況下可促進退化,而在另一種情況下,卻促進再生。這是顛倒的,完全不同于我們所期望的。我們認為這一途徑可能會采取行動清除感染的細胞,所以感染不能擴散到健康的組織。只有當(dāng)我們阻斷該通路時,我們才能即使在感染的情況下也能允許再生發(fā)生。”

Sánchez Alvarado說,在未來,我們有可能會開發(fā)出小分子,抑制這一免疫途徑,以提高組織的修復(fù)和再生,不只是在一個像渦蟲這樣簡單的生物體中,而且在更高等的生物(如人類)中也一樣。然而,我們首先需要對這一途徑中的激活劑和抑制劑,以及它們?nèi)绾蜗嗷プ饔茫私飧唷?br>
Arnold說:“我們的醫(yī)療體系正在努力解決受損傷口愈合的情況。我們知道,細菌是治愈患者的障礙,而抗生素并不總是有效的,尤其是抗生素耐藥性細菌的興起。通過了解參與免疫應(yīng)答的基因和途徑,我們或許能夠闡明決定一個生物體是否修復(fù)或試圖再生的信號。也許,我們可以開發(fā)更有效的治療方法。”

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