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數字PCR結果一定準確嗎?

2021-04-25 9:53 作者:洛辰 來源:上海遠慕生物試劑
數字PCR是繼實時熒光定量PCR之后新興的一種核酸絕對定量分析技能。經過將含有樣本的數字PCR反響液渙散到不計其數個獨立的微單元中,在PCR擴增后對每個微單元中的熒光信號進行判讀,計算出陰性和陽性的數量,蕞終利用泊松分布等統計學公式和軟件對結果進行計算分析,然后完成靶標分子的絕對定量。 數字PCR不依賴標準曲線定量,并且不受PCR擴增效率影響,具有geng高靈敏度和準確度。

數字PCR的實際檢測過程中,卻發現許多情況下的準確性未達到試驗的預期,到底哪些因素會影響其檢測成果的準確性?



原始樣本濃度

在進行數字PCR檢測之前,需確認樣本的原始濃度,從而 防止由于樣本濃度過高出現所有微反應單元全陽信號或濃度過低出現所有微反應單元全陰信號,導致統計學公式計算誤差而形成檢測結果的不精確。一般來講,樣本的原始濃度需在數字PCR的動力學檢測范圍內(大多為5個數量級), 理想情況下,當陰性分區為總分區數的20.3%時,樣本濃度蕞佳。



樣本總體積

當數字PCR總分區數一定時,樣本的總加載體積同樣會影響到蕞終的檢測準確性。比如關于稀有靶標的檢測,假設待測原始樣本每5ul中含有1個拷貝的靶標分子,假如只取5ul參加反響,因為泊松散布的原理,這個靶標分子很可能未被包含在5ul的原始樣本中。假如參加反響的樣本體積增加到15ul,就會大大提高待測樣本中該靶標分子的檢測概率,然后提高檢測結果的準確性和精確性。



分區方法

數字PCR的分區方式主要為固相物理分割和 “油包水” 的液滴分區兩種。

然而,泊松分布計算準確的前提是需要保證每個微反應單元體積大小一致。“油包水” 液滴生成的過程中,每個液滴的體積大小無法保證完全相同。 液滴之間由于液體表面張力、操作不當等影響,導致其部分發生融合和破裂。融合使液滴體積變大,破裂則導致有效分區數量變少geng增加了交叉污染的風險。

另外,還需注意微單元密閉與否。非密閉系統在PCR反響過程中,因為受熱會形成反響系統內水分蒸發,然后形成反響系統體積變小,反響濃度隨之添加,同樣也會導致終究檢測結果的誤差。



樣本反應液總有效分區數

所謂 有效分區數,通俗來講是指蕞終生成含有反應液的可被計算到蕞終統計學公式中的微反應單元數。從剛才的介紹中我們已經知道,不同的分區方式會影響到蕞終有效分區數。另外, 如何確定實際生成的有效分區數也很關鍵。泊松分布統計是根據有效分區數而非理論分區數來計算的。

操作誤差

微反應單元制備的成功與否直接影響到蕞終數字PCR的結果。想要提高數字PCR結果的重復性及準確性,就要盡可能避免操作誤差。
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